Análisis de ADN mitocondrial en una muestra de restos óseos arcaicos del periodo Herrera en la sabana de Bogotá

Alejandro Silva, Ignacio Briceño, Javier Burgos, Diana Torres, Victoria Villegas, Alberto Gómez, Jaime Eduardo Bernal, .

Palabras clave: ADN mitocondrial/análisis, polimorfismo de nucleótido simple, haplotipos, arqueología, población indígena, Colombia

Resumen

Introducción. Los restos óseos arcaicos son fuente privilegiada de información biológica y su caracterización genética permite confirmar o descartar filiaciones propuestas por otras aproximaciones científicas. La historia precolombina de los Andes orientales se divide en tres periodos principales: i) un poblamiento temprano por parte de grupos cazadores-recolectores; ii) un periodo intermedio (Herrera) de pueblos con agricultura incipiente, y iii) un periodo tardío de pueblos chibchas, agrícolas y alfareros (agroalfarero).
Objetivo. Analizar el ADN mitocondrial de restos óseos del periodo Herrera.
Materiales y métodos. Se analizaron 11 individuos pertenecientes al yacimiento arqueológico Madrid 2-41, con una edad aproximada de 2.000 años. Un fragmento (192 pb) del segmento hipervariable I fue amplificado y secuenciado, siguiendo criterios estrictos de autenticidad de ADN arcaico. Las secuencias se compararon con las existentes en bases de datos de Norteamérica y Europa usando herramientas bioinformáticas.
Resultados. Todas las secuencias resultaron idénticas y fueron clasificadas como haplogrupo B. Esto puede relacionarse con el tipo de entierro ritual practicado en Madrid 2-41, es decir, probablemente los individuos analizados hagan parte de una familia jerárquicamente importante en la antigua sociedad Herrera. La búsqueda de secuencias homólogas en las bases de datos estadounidense y europea no arrojó coincidencias exactas, aunque existe el reporte de un individuo amazónico de ~4.000 años de antigüedad (Brasil) cuya secuencia coincide con la hallada en Madrid 2-41.
Conclusión. Los individuos del yacimiento arqueológico Madrid 2-41 están estrechamente emparentados entre sí por línea materna y presentan una secuencia aparentemente ausente en poblaciones actuales.

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  • Alejandro Silva Instituto de Genética Humana, Pontificia Universidad Javeriana, Bogotá, D.C., Colombia
  • Ignacio Briceño Facultad de Medicina, Universidad de La Sabana, Chía, Cundinamarca, Colombia
  • Javier Burgos Instituto de Estudios Ambientales, Universidad Nacional de Colombia, Bogotá, D.C., Colombia
  • Diana Torres Instituto de Genética Humana, Pontificia Universidad Javeriana, Bogotá, D.C., Colombia
  • Victoria Villegas Instituto de Genética Humana, Pontificia Universidad Javeriana, Bogotá, D.C., Colombia
  • Alberto Gómez Instituto de Genética Humana, Pontificia Universidad Javeriana, Bogotá, D.C., Colombia
  • Jaime Eduardo Bernal Instituto de Genética Humana, Pontificia Universidad Javeriana, Bogotá, D.C., Colombia

Referencias

1. Horai S, Kondo R, Nakagawa-Hattori Y, Hayashi S, Sonoda S, Tajima K. Peopling of the Americas, founded by four major lineages of mitochondrial DNA. Mol Biol Evol. 1993;10:23-47.
2. Schurr TG, Ballinger SW, Gan YY, Hodge JA, Merriwether DA, Lawrence DN, et al. Amerindian mitochondrial DNAs have rare Asian mutations at high frequencies, suggesting they derived from four primary maternal lineages. Am J Hum Genet. 1990;46:613-23.
3. Schurr TG. The peopling of the new world: Perspectives from molecular anthropology. Annu Rev Anthropol. 2004;33:551-83.
4. Torroni A, Schurr TG, Yang CC, Szathmary EJ, Williams RC, Schanfield MS, et al. Native American mitochondrial DNA analysis indicates that the Amerind and the Nadene populations were founded by two independent migrations. Genetics. 1992;130:153-62.
5. Melton PE, Briceño I, Gómez A, Devor EJ, Bernal JE, Crawford MH. Biological relationship between Central and South American Chibchan speaking populations: evidence from DNA. Am J Phys Anthropol. 2007;133:753-70.
6. Wallace DC, Garrison K y Knowler WC. Dramatic founder effects in Amerindian mitochondrial DNA. Am J Phys Anthropol. 1985;68:149-55.
7. Bailliet G, Rothhammer F, Carnese FR, Bravi CM, Bianchi NO. Founder mitochondrial haplotypes in Amerindian populations. Am J Hum Genet. 1994; 55: 27-33.
8. Macaulay V, Richards M, Hickey E, Vega E, Cruciani F, Guida V, et al. The emerging tree of West Eurasian mtDNAs: A synthesis of control-region sequences and RFLPs. Am J Hum Genet. 1999;64:232-49.
9. Rondón-González F, Cifuentes L, Cárdenas H, Barreto G. Evaluación de la diversidad genética mediante el análisis de mtDNA en poblaciones aisladas del centro y suroccidente colombiano. Salud Uninorte. 2004;18:74.
10. Rondón-González F, Torres AM, Barreto G. Relaciones filéticas de comunidades indígenas colombianas a partir de la comparación de secuencias de mtDNA y sus implicaciones en el poblamiento del continente americano. Salud Uninorte. 2004;18:88.
11. Briceño I, Umaña A, Bernal JE, Torres DM. Estudios moleculares en poblaciones amerindias. Salud Uninorte. 2004;18:76.
12. Acosta MA, Salas A, Álvarez V, Lareu MV, Carracedo A. El ADN mitocondrial revela la condición multiétnica de las poblaciones del Cauca (Colombia). Salud Uninorte. 2004;18:78.
13. Roa M. Polimorfismos de la región control del ADN mitocondrial humano en una muestra de población mestiza del altiplano cundiboyacense colombiano. (tesis). Bogotá, D.C.: Universidad Nacional de Colombia; 2005. p. 140.
14. Torroni A, Schurr TG, Cabell MF, Brown MD, Neel JV, Larsen M, et al. Asian affinities and continental radiation of the four founding native American mtDNAs. Am J Hum Genet. 1993;53:563-90.
15. Keyeux G, Rodas C, Gelvez N, Carter D. Possible migration routes into South America deduced from mitochondrial DNA studies in Colombian Amerindian populations. Hum Biol. 2002;74:211-33.
16. Jones M. Ancient DNA in pre-Columbian archaeology: a review. J Archaeol Sci. 2003;30:629-35.
17. Lleonart R, Riego E, Rodríguez R, Travieso R, de la Fuente J. Analyses of DNA from ancient bones of a pre-columbian Cuban woman and a child. Genet Mol Biol. 1999;22:285-89.
18. Stone A, Stoneking M. mtDNA analysis of a prehistoric Oneota population: implications for the peopling of the New World. Am J Hum Genet. 1998;62:1153-70.
19. Lalueza C, Perez-Perez A, Prats E, Cornudella L, Turbon D. Lack of founding American mitochondrial DNA lineages in extinct aborigines from Tierra del Fuego-Patagonia. Hum Mol Genet. 1997;6:41-6.
20. Lalueza-Fox C, Luna Calderon F, Calafell F, Morera B, Bertranpetit J. MtDNA from extinct Tainos and the peopling of the Caribbean. Ann Hum Genet. 2001;65:137-51.
21. García-Bour J, Pérez-Pérez A, Álvarez S, Fernández E, López-Parra AM, Arroyo-Pardo E, et al. Early population differentiation in extinct aborigines from Tierra del Fuego-Patagonia: Ancient mtDNA sequences and Y-chromosome STR characterization. Am J Phys Anthropol. 2004;123:361-70.
22. Luciani S, Fornaciari G, Rickards O, Martínez C, Rollo F. Molecular characterization of a Pre-Columbian mummy and in situ coprolite. Am J Phys Anthropol. 2006;129:620-9.
23. Ribeiro-Dos-Santos AK, Santos SE, Machado AL, Guapindaia V, Zago M. Heterogeneity of mitochondrial DNA haplotypes in Pre-Columbian natives of the Amazon region. Am J Phys Anthropol. 1996;101:29-37.
24. Shimada I, Shinoda K, Farnum J, Corruccini R, Watanabe H. An integrated analysis of Pre-Hispanic mortuary practices: A middle Sicán case study. Curr Anthropol. 2004;45:369-402.
25. Shinoda K, Adachi N, Guillen S, Shimada I. Mitochondrial DNA analysis of ancient Peruvian highlanders. Am J Phys Anthropol. 2006;131:98-107.
26. Moraga M, Santoro CM, Standen VG, Carvallo P, Rothhammer F. Microevolution in prehistoric Andean populations: Chronologic mtDNA variation in the desert valleys of northern Chile. Am J Phys Anthropol. 2005; 127:170-81.
27. Monsalve MV, Cárdenas F, Guhl F, Delaney AD, Devine DV. Phylogenetic analysis of mtDNA lineages in South American mummies. Ann Hum Genet. 1996;60:293-303.
28. Fernández C. La arqueología molecular aplicada a la solución de problemas prehistóricos: análisis de ADN mitocondrial en momias y restos óseos prehispánicos (tesis). Bogotá: Universidad Nacional de Colombia; 1999.
29. Rodríguez JV, Cifuentes A. Un yacimiento formativo ritual en el entorno de la antigua laguna de La Herrera, Madrid, Cundinamarca. Maguaré. 2005;19:103-31.
30. Kalmár T, Bachrati CZ, Marcsik A, Raskó I. A simple and efficient method for PCR amplifiable DNA extraction from ancient bones. Nucleic Acids Res. 2000;28:e67.
31. Kemp BM, Smith DG. Use of bleach to eliminate contaminating DNA from the surface of bones and teeth. Forensic Sci Int. 2005;154:53-61.
32. Vigilant L, Pennington R, Harpending H, Kocher TD, Wilson AC. Mitochondrial DNA sequences in single hairs from a southern African population. Proc Natl Acad Sci USA. 1989;86:9350-4.
33. Cooper A, Poinar HN. Ancient DNA: Do it right or not at all. Science. 2000;289:1139.
34. Monson KL, Miller KW, Wilson MR, DiZinno JA, Budowle B. The mtDNA population database: An integrated software and database resource for forensic comparison. Forensic Sci Commun. 2002;4. [Fecha de consulta: agosto de 2007]. Disponible en: http:// www.fbi.gov/hq/lab/fsc/backissu/april2002/miller1.htm
35. Horai S, Hayasaka K. Intraspecific nucleotide sequence differences in the major noncoding region of human mitochondrial DNA. Am J Hum Genet. 1990;46:828-42.
36. Correa F. El sol del poder. Bogotá D.C.: Unibiblos, Universidad Nacional de Colombia; 2004.
37. Langebaek CH. Regional archaeology in the Muisca territory: a study or the Fúquene and Susa Valleys. Memoirs in Latin American Archaeology No. 9, Bogotá, University of Pittsburgh Latin American Archaeology Publications and Universidad de los Andes; 1995.
 
Cómo citar
Silva, A., Briceño, I., Burgos, J., Torres, D., Villegas, V., Gómez, A., & Bernal, J. E. (1). Análisis de ADN mitocondrial en una muestra de restos óseos arcaicos del periodo Herrera en la sabana de Bogotá. Biomédica, 28(4), 569-577. https://doi.org/10.7705/biomedica.v28i4.62

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