Bioinformática en Colombia: presente y futuro de la investigación biocomputacional
Resumen
La bioinformática, como la conocemos hoy en día, es una de las ciencias con mayor proyección en la adquisición de conocimiento científico. Contrario a lo que se piensa, esta ciencia tuvo sus inicios en los años 50, pero no fue sino hasta hace un par de décadas cuando tuvo su verdadero auge con la creación de las primeras bases de datos y el desarrollo de algoritmos computacionales diseñados para el análisis de secuencia.
El desarrollo científico y tecnológico alcanzado a nivel mundial, constantemente nos lleva a evaluar las posibilidades de transferencia de esos logros a nuestra sociedad científica. En este punto, la bioinformática se ha sumado a la larga lista de retrasos científicos de los cuales padece constantemente nuestra sociedad.
No obstante, las nuevas proyecciones y políticas de investigación y desarrollo logradas recientemente en nuestro país, han abierto definitivamente el camino para la aplicación y desarrollo de la bioinformática, la cual durante años ha sido mantenida tímidamente como objeto de estudio por pocos grupos de investigación de nuestro país. Una vez fueron propuestos los actuales modelos de sostenimiento y desarrollo con base biotecnológica, se ha dado un salto generacional en la investigación computacional en Colombia y nuestros objetivos científicos, aunque a largo plazo, están trazados al mismo nivel de países como Chile, Argentina, Brasil y México, que son los referentes inmediatos para la región.
En este breve ensayo queremos resaltar la situación actual en la investigación bioinformática llevada a cabo en nuestro país, así como también, plantear las perspectivas que se esperan para esta ciencia de gran impacto a nivel mundial.
Descargas
Referencias bibliográficas
2. Dayhoff M, Schwartz R, Orcutt B. A model of evolutionary change in proteins. En: Atlas of Protein Sequence and Structure. Dayhoff MO, editor. Washington D.C.: National Biomedical Research Foundation-NBR; 1978. p. 345-52.
3. Smith TF, Waterman MS. Identification of common molecular subsequences. J Mol Biol. 1981;147:195-7.
4. Lipman DJ, Pearson WR. Rapid and sensitive protein similarity searches. Science. 1985;227:1435-41.
5. Altschul SF, Gish W, Miller W, Myers EW, Lipman DJ. Basic local alignment search tool. J Mol Biol. 1990;215:403-10.
6. Fleischmann RD, Adams MD, White O, Clayton RA, Kirkness EF, Kerlavage AR, et al. Whole-genome random sequencing and assembly of Haemophilus influenzae.. Science. 1995;269:496-512.
7. Blattner FR, Plunkett G 3rd, Bloch CA, Perna NT, Burland V, Riley M, et al. The complete genome sequence of Escherichia coli K-12. Science. 1997;277:1453-74.
8. Peña MD, Castellanos O, Carrizosa S, Jiménez C, Del Portillo P. La biotecnología, motor de desarrollo para la Colombia de 2015. Bogotá D.C.: Colciencias; 2008.
9. Gutiérrez AJ, Arenas AF, Gómez-Marín JE. Molecular evolution of serine/arginine splicing factors family (SR) by positive selection. In Silico Biol. 2006;6:32.
10. Matute DR, Barreto-Hernández E, Falquet L. Hunting for insect-specific protein domains. In Silico Biol. 2006;6:35-42.
11. Arenas AF, Gutiérrez AJ, Gómez-Marín JE. Evolutionary origin of the protozoan parasites histone-like proteins (HU). In Silico Biol. 2007;8:2.
12. Benítez-Páez A. Sequence analysis of the receptor activity-modifying proteins family, new putative peptides and structural conformation inference. In Silico Biol. 2006;6:467-83.
13. Benítez-Páez A, Cárdenas-Brito S. Dissection of functional residues in receptor activity- modifying proteins through phylogenetic and statistical analyses. Evol Bioinform Online. 2008;4:153-67.
14. Garnica DP, Pinzón AM, Quesada-Ocampo LM, Bernal AJ, Barreto E, Grunwald NJ, et al. Survey and analysis of microsatellites from transcript sequences in Phytophthora species: frequency, distribution, and potential as markers for the genus. BMC Genomics. 2006;7:245.
15. Acevedo OE, Lareo LR. Amino acid propensities revisited. OMICS. 2005;9:391-9.
16. Mejía-Guerra MK, Lareo LR. In silico identification of regulatory elements of GRIN1 genes. OMICS. 2005;9:106-15.
17. Sáenz H, Lareo L, Poutou RA, Sosa AC, Barrera LA. Computational prediction of the tertiary structure of the human iduronate 2-sulfate sulfatase. Biomédica. 2007;27:7-20.
18. Ulloa JC, Matiz A, Lareo L, Gutiérrez MF. Molecular analysis of a 348 base-pair segment of open reading frame 2 of human astrovirus. A characterization of Colombian isolates. In Silico Biol. 2005;5:537-46.
19. Narváez G, Lareo L, Rincón J. Mathematical models to correlate molecular topology with substrate affinity of the glycine antagonist in glutamate receptors. Biomédica. 2007;27:116-32.
20. Benítez-Páez A, Cárdenas-Brito S. Dissection of functional residues in receptor activity-modifying proteins through phylogenetic and statistical analyses. Evol Bioinform Online. 2008;4:153-69.
21. Restrepo-Montoya D, Vizcaíno C, Niño LF, Ocampo M, Patarroyo ME, Patarroyo MA. Validating subcellular localization prediction tools with mycobacterial proteins. BMC Bioinformatics. 2009;10:134.
22. Benítez-Páez A. Considerations to improve functional annotations in biological databases. OMICS 2009;13:527-32.
23. Pohlhaus JR, Cook-Deegan RM. Genomics research: world survey of public funding. BMC Genomics. 2008;9:472.
Algunos artículos similares:
- Elizabeth Borrero, Gabriel Carrasquilla, Neal Alexander, Descentralización y reforma: ¿cuál es su impacto sobre la incidencia de malaria en los municipios colombianos? , Biomédica: Vol. 32 (2012): Suplemento 1, Malaria
- Raúl Murillo, Ricardo Cendales, Carolina Wiesner, Marion Piñeros, Sandra Tovar, Efectividad de la citología cérvico-uterina para la detección temprana de cáncer de cuello uterino en el marco del sistema de salud de Colombia , Biomédica: Vol. 29 Núm. 3 (2009)
- Sandra Lorena Girón, Julio César Mateus, Fabián Méndez, Impacto de un botadero a cielo abierto en el desarrollo de síntomas respiratorios y en costos familiares de atención en salud de niños entre 1 y 5 años en Cali, Colombia , Biomédica: Vol. 29 Núm. 3 (2009)
- José Joaquín Carvajal, Ligia Inés Moncada, Mauricio Humberto Rodríguez, Ligia del Pilar Pérez, Víctor Alberto Olano, Caracterización preliminar de los sitios de cría de Aedes (Stegomyia) albopictus (Skuse, 1894) (Diptera: Culicidae) en el municipio de Leticia, Amazonas, Colombia , Biomédica: Vol. 29 Núm. 3 (2009)
- Andrés Páez, Gloria Rey, Carlos Agudelo, Alvaro Dulce, Edgar Parra, Hernando Díaz-Granados, Damaris Heredia, Luis Polo, Brote de rabia urbana transmitida por perros en el distrito de Santa Marta, Colombia, 2006-2008 , Biomédica: Vol. 29 Núm. 3 (2009)
- Patricia Escobar, Katherine Paola Luna, Indira Paola Hernández, César Mauricio Rueda, María Magdalena Zorro, Simon L. Croft, Susceptibilidad in vitro a hexadecilfosfocolina (miltefosina), nifurtimox y benznidazole de cepas de Trypanosoma cruzi aisladas en Santander, Colombia , Biomédica: Vol. 29 Núm. 3 (2009)
- Gustavo Pradilla, Julio César Mantilla, Reynaldo Badillo, Encefalitis rábica humana por mordedura de murciélago en un área urbana de Colombia , Biomédica: Vol. 29 Núm. 2 (2009)
- Mauricio Beltrán, María Cristina Navas, María Patricia Arbeláez, Jorge Donado, Sergio Jaramillo, Fernando De la Hoz, Cecilia Estrada, Lucía del Pilar Cortés, Amalia de Maldonado, Gloria Rey, Seroprevalencia de infección por virus de la hepatitis B y por virus de la inmunodeficiencia humana en una población de pacientes con múltiples transfusiones en cuatro hospitales, Colombia, Sur América , Biomédica: Vol. 29 Núm. 2 (2009)
- Rosa Magdalena Uscátegui, Adriana M. Correa, Jaime Carmona-Fonseca, Cambios en las concentraciones de retinol, hemoglobina y ferritina en niños palúdicos colombianos , Biomédica: Vol. 29 Núm. 2 (2009)
- Claudia M.E. Romero-Vivas, Luis Eduardo Castro, Lila Visbal, Ana María Santos, Esther Díaz, Miasis cutánea por Cochliomyia hominivorax (Coquerel) (Díptera: Calliphoridae) en el Hospital Universidad del Norte, Soledad, Atlántico , Biomédica: Vol. 29 Núm. 1 (2009)
Estadísticas de artículo | |
---|---|
Vistas de resúmenes | |
Vistas de PDF | |
Descargas de PDF | |
Vistas de HTML | |
Otras vistas |