De genotipos e isonimias: análisis de correlación entre el apellido y el patrimonio genético heredado en el cromosoma Y en la población de tres departamentos del suroccidente colombiano
Resumen
Introducción. Es bien sabido que, entre los caracteres transmitidos por la línea paterna, el apellido se ha configurado en diferentes culturas como un carácter semejante a un alelo genético neutral asociado al cromosoma Y.
Objetivo. En este estudio se determinaron las frecuencias en la población de 17 STR del cromosoma Y en 308 individuos provenientes de las poblaciones de los departamentos del Valle del Cauca, Cauca y Nariño. Además, se propuso definir la correlación de los haplotipos obtenidos en cada individuo con su apellido paterno, para comparar estos dos códigos de identidad.
Materiales y métodos. Se extrajo el ADN de cada individuo a partir de sangre periférica y se utilizó el estuche comercial AmpFLSTR® Yfiler™ (Applied Biosystems) para tipificarlo. Los resultados de los haplotipos moleculares se compararon con los apellidos reportados por cada individuo y se asociaron apellidos amerindios y europeos con haplotipos que incluyeran o no el marcador DYS19/13, característico de la población amerindia.
Resultados. Se reportan las frecuencias alélicas de cada uno de los 17 marcadores del cromosoma Y analizados en esta región de Colombia, así como la diversidad génica y haplotípica hallada en los tres departamentos. Al comparar los resultados obtenidos a nivel molecular con los apellidos de origen europeo o amerindio reportados por cada uno de los individuos, se encontró cerca de 40% de inconsistencia de linaje.
Conclusiones. La utilización del apellido como marcador de población debe hacerse con cautela, por cuanto las genealogías fundamentadas en éstos pueden no corresponder al origen biológico de sus portadores.
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Referencias bibliográficas
1. Roewer L, Kayser M, Dieltjes P, Nagy M, Bakker E, Krawezak M, et al. Analysis of molecular variance (AMOVA) of Y-chromosome-specific microsatellites in two closely related human populations. Hum Mol Genet. 1996;5:1029-33.
2. Jobling MA, Pandya A, Tyler-Smith C. The Y chromosome in forensic analysis and paternity testing. Int J Legal Med. 1997;110:118-24.
3. Prinz M, Boll K, Baum H, Shaler B. Multiplexing of Y chromosome specific STR and performance for mixed samples. Forensic Sci Int.1997;85:209-18.
4. Kayser M, Cagliá A, Corach D, Fretwell N, Gehrig C, Graziosi G, et al. Evaluation of Y-chromosomal STR: a multicenter study. Int J Legal Med. 1997;110: 125-33.
5. De Knijff P, Kayser M, Cagliá A, Corach D, Fretwell N, Gehrig C, et al. Chromosome Y microsatellites: population genetic and evolutionary aspects. Int J Legal Med. 1997;110:134-49.
6. Paredes M, Galindo A, Bernal M, Avila S, Andrade D, Vergara C, et al. Analysis of the CODIS autosomal STR loci in four main Colombian regions. Forensic Science Int. 2003;137:67-73.
7. Bravo ML, Moreno MA, Builes JJ, Salas A, Lareu MV, Carracedo A. Autosomal STR genetic variation in negroid Chocó and Bogotá populations. Int J Legal Med. 2001;115:102-4.
8. Cifuentes L, Bonilla V, Rondón F, Cárdenas H, Barreto G. Evaluación de la diversidad genética mediante el análisis de STR en poblaciones aisladas del centro y suroccidente colombiano. Revista de la División de Ciencias de la Salud Universidad del Norte. 2004;18:96.
9. Yunis JJ, Acevedo LE, Campo DS, Yunis EJ. Population data of Y-STR minimal haplotypes in a sample of Caucasian-Mestizo and African descent individuals of Colombia. Forensic Sci Int. 2005;151:307-13.
10. Gaviria AA, Ibarra AA, Palacio OD, Posada YC, Triana O, Ochoa LM, et al. Y-chromosome haplotype analysis in Antioquia (Colombia). Forensic Sci Int. 2005;151:85-91.
11. Builes JJ, Bravo ML Martínez-Pancorbo M, Moreno MA, Gómez CP. Discrimination index of Y-chromosomal haplotypes in an Antioquia (Colombia) population sample. Int Congr Ser. 2004;1261:275-7.
12. Yunis JJ, García O, Cuervo AG, Guío E, Pineda CR, Yunis EJ. Population data for PowerPlex 16 in thirteen departments and the capital city of Colombia. J Forensic Sci 2005; 50:685-702.
13. Torres MM. La variabilidad genética una herramienta útil en el estudio de poblaciones humanas. (Tesis doctoral). Bogotá D.C.: Universidad de los Andes; 2005.
14. Builes JJ, Castañeda SP, Espinal C, Aguirre D, Gómez MV, Villamarin D, et al. Analysis of 16 Y-chromosomal STR in a Valle (Colombia) population sample. Int Congr Ser. 2006;1288:219-21.
15. Romero RH. Determinación de haplotipos del cromosoma-Y en población de la Costa Caribe colombiana y su utilidad en el campo forense. (Tesis de Maestría). Bogotá D.C.: Pontificia Universidad Javeriana; 2006.
16. Builes JJ, Bravo ML, Montoya A, Caraballo L, Martinez B, Moreno MA. Population genetics of eight new Y-chromosomal STR haplotypes in three Colombian populations: Antioquia, Chocó and Cartagena. Int Congr Ser. 2004;1261:310-2.
17. Carvajal-Carmona LG, Soto ID, Pineda N, Ortiz-Barrientos D, Duque C, Ospina-Duque J, et al. Strong Amerind/white sex bias and a possible sephardic contribution among the founders of a population in north-west Colombia. Am J Hum Genet. 2000;67:1287-95.
18. Guarino FD, Federle RA, van Oorschot RAH, Briceño I, Bernal JE, Papiha SS, et al. Genetic diversity among five native american tribes of Colombia. En: Papiha SS, Deka R, Chakraborty R, editors. Genetic diversity: Applications in human population genetics. New York: Kluwer Academic/Plenum Publishers; 1999.p.33-51.
19. Lopera JA, Soto ID, Mondragón MC, Caraballo L, Bedoya BG, Ruiz-Linares A. Estructura genética de la población actual del Palenque de San Basilio (Bolívar, Colombia). Revista de la División de Ciencias de la Salud Universidad del Norte. 2004;18:97.
20. Sykes B, Irven C. Surnames and the Y chromosome. Am. J Hum Genet. 2000;66:1417-9.
21. Jobling MA. In the name of the father: surnames and genetics. Trends Genet. 2001;17:353-7.
22. Vernay M. Répartition géographique des patronymes et structure génétique: le département de l´Ardèche au début du XXe siècle. C R Acad Sci III. 2001;324:589-99.
23. Morelli L, Paoli G, Francalacci P. Surname analysis of the Corsican population reveals an agreement with geographical and linguistic structure. J Biosoc Sci. 2002;34:289-310.
24. Bedoya G, García J, Montoya P, Rojas W, Amézquita ME, Soto I, et al. Análisis de isonimia entre poblaciones del noroeste de Colombia. Biomédica. 2006;26:538-45.
25. Zei G, Lisa A, Fiorani O, Magri C, Quintana-Murci L, Semino O, et al. From surnames to the history of Y chromosome: the Sardinian population as a paradigm. Eur J Hum Genet. 2003;11:802-7.
26. Mikerezi I, Pizzetti P, Lucchetti E, Ekonomi M. Isonymy and the genetic structure of Albanian populations. Coll Anthropol. 2003;27:507-14.
27. Bedoya G, Montoya P, García J, Soto I, Bourgeois S, Carvajal L, et al. Admixture dynamics in Hispanics: A shift in the nuclear genetic ancestry of a South American population isolate. Proc Nat Acad Sci USA. 2006;103:7234-9.
28. Walsh PS, Metzger DA, Higuchi R. Chelex 100 as a medium for simple extraction of DNA for PCR-based typing from forensic material. Biotechniques. 1991;4:506-13.
29. Mulero J, Chang C, Calandro L, Green R, Li Y,Johnson C, et al. Development and validation of the AmpFLSTR® Yfiler™ PCR amplification kit: A male specific, single amplification 17 Y-STR multiplex system. J Forensic Sci. 2006;51:64-75.
30. Romero RH, Lizarazo R. Validation of the AmpFLSTR Yfiler kit. Int Congr Ser. 2006;1288:280-2.
31. Sensabaugh GF, Biochemical markers of individuality. En: Saferstein R, editor. Forensic Science Handbook. Englewood Cliffs NJ: Prentice Hall, Inc: 1982. p. 379-414.
32. Butler JM. State of the Y chromosome: New advances and state of the science for Y chromosome DNA testing. [Consultado: 09/05/2008]. Disponible en: http:// www.cstl.nist.gov/biotech/strbase/pub_pres/ TorontoJune2005_Y.pdf
33. Jones DA. Blood samples probability of discriminations. J Forensic Sci Soc. 1972;12:355-9.
34. Nei M. Molecular evolutionary genetics. New York: Columbia University Press; 1987. p. 176-9.
35. Cagliá A, Dobosz M, Boschi I, d´Aloja E, Pascali VL. Increased forensic efficiency of a STR-based Y-specific haplotype by addition of the highly polymorphic DYS385 locus. Int J Legal Med. 1998;111:142-6.
36. Kayser M, Krawczak M, Excoffier L, Dieltjes P, Corach D, Pascali V, et al. An extensive analysis on Y-chromosomal microsatellite haplotypes in globally dispersed human populations. Am J Hum Genet. 2001;68:990-1018.
37. Cifuentes L, Morales R, Sepúlveda D, Jorquera H, Acuña M. DYS19 and DYS199 loci in a Chilean population of mixed ancestry. Am J Phys Anthropol. 2004;125:85-9.
38. Departamento Administrativo Nacional de Estadística. Censo 2005. [Consultado: 09/05/2008]. Disponible en: http://www.dane.gov.co/censo/
39. Willuweit S, Roewer L. Y chromosome haplotype reference database (YHRD): Update. Forensic Sci Int Genet. 2007;1:83-7.
40. Bosch E, Calafell F, Perez-Lezaun A, Comas D, Izaabel H, Akhayat O, et al. Y-chromosome STR haplotypes in four populations from northwest Africa. Int J Legal Med. 2000;114:36-40.
41. Dipierri JE, Alfaro E, Martínez-Marignac VL, Bailliet G, Bravi CM, Cejas S, et al. Paternal directional mating in two Amerindian subpopulations located at different altitudes in northwestern Argentina. Hum Biol. 1998;70:1001-10.
42. Bailliet G, Castilla EE, Adams JP, Orioli IM, Martínez- Marignac VL, Richard SM, et al. Correlation between molecular and conventional genealogies in Aicuña: a rural population from northwestern Argentina. Hum Hered. 2001;51:150-9.
43. Pettener D, Pastor S, Tarazona-Santos E. Surnames and genetic structure of a high-altitude Quechua community from the Ichu River Valley, Peruvian Central Andes, 1825-1914. Hum Biol. 1998; 70:865-87.
44. King TE, Ballereau SJ, Shürer KE, Jobling MA. Genetic signatures of coancestry within surnames. Curr Biol. 2006;16:384-8.
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- Juan J. Yunis, Luis E. Acevedo, David S. Campo, Emilio J. Yunis, Origen geno-geográfico de haplotipos STR del cromosoma Y en una muestra caucásico-mestiza y afrodescendiente de Colombia , Biomédica: Vol. 33 Núm. 3 (2013)
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