Validación clínica de la prueba RT-LAMP para el diagnóstico rápido del SARS-CoV-2

Leidy Hurtado , Diana Díaz , Katherine Escorcia, Laura Flórez , Yesit Bello , Yirys Díaz , Elkin Navarro , Leonardo C. Pacheco, Nataly Galán , Ronald Maestre , Antonio Acosta, Lisandro A. Pacheco , .

DOI: https://doi.org/10.7705/biomedica.6523
Palabras clave: COVID-19/diagnóstico, técnicas de diagnóstico molecular, sensibilidad y especificidad, pruebas en el punto de atención
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Resumen

Introducción. Desde el primer reporte en la provincia de Wuhan (China) en el año 2019, el SARS-CoV-2 se ha diseminado por todo el mundo, provocando un enorme impacto en la salud pública. Para su diagnóstico, la Organización Mundial de la Salud ha incentivado el desarrollo de pruebas rápidas, de simple ejecución, sensibles y específicas, que complementan la RT-qPCR como prueba de referencia. La prueba RT-LAMP ha mostrado ser una excelente alternativa para la detección del SARS-CoV-2 en diferentes biofluidos.
Objetivo. Validar la técnica RT-LAMP colorimétrica en muestras de hisopado nasofaríngeo previamente confirmadas por RT-qPCR, usando el protocolo Charité, Berlín, Alemania.
Materiales y métodos. Un total de 153 muestras de hisopado nasofaríngeo de individuos con sospecha de COVID-19 se sometieron a RT-qPCR y RT-LAMP, usando un estuche comercial colorimétrico (NEB, Germany). La RT-LAMP se practicó con las muestras de ARN extraídas del hisopado nasofaríngeo y con muestras crudas sin previa extracción de ARN. El resultado fue evaluado por un simple cambio de color en la reacción.
Resultados. La sensibilidad y especificidad de la técnica RT-LAMP para detectar el gen N del SARS-CoV-2 mediante un set de cebadores previamente reportados (set de Broughton), arrojó valores de 0,97 (0,85-1,00) y 0,81 (0,65-0,92), respectivamente, con un intervalo de confianza del 95%. Otro set de cebadores dirigidos contra otra región del mismo gen (set de Lalli) arrojó valores de sensibilidad y especificidad de 0,96 (0,78-1,00) y 0,77 (0,55-0,92), respectivamente. Sin previa extracción de ARN, se encontró que la sensibilidad fue del 0,95 (0,74-1,00) y la especificidad del 0,88 (0,64-0,99).
Conclusiones. Estos resultados evidencian que la técnica RT-LAMP podría considerarse una prueba diagnóstica rápida, de fácil ejecución, libre de equipos sofisticados, sensible y específica, para el diagnóstico del SARS-CoV-2 en muestras de hisopados nasofaríngeos.

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  • Leidy Hurtado División Ciencias de la Salud, Universidad del Norte, Barranquilla, Colombia https://orcid.org/0000-0001-8371-5121
  • Diana Díaz División Ciencias de la Salud, Universidad del Norte, Barranquilla, Colombia https://orcid.org/0000-0002-2228-3799
  • Katherine Escorcia Programa de Microbióloga, Universidad Simón Bolívar, Barranquilla, Colombia https://orcid.org/0000-0002-3135-6101
  • Laura Flórez Programa de Microbióloga, Universidad Simón Bolívar, Barranquilla, Colombia https://orcid.org/0000-0002-8670-8493
  • Yesit Bello Unidad de Genética y Biología Molecular, Facultad de Ciencias Básicas y Biomédicas, Universidad Simón Bolívar, Barranquilla, Colombia https://orcid.org/0000-0003-1006-0042
  • Yirys Díaz División Ciencias de la Salud, Universidad del Norte, Barranquilla, Colombia https://orcid.org/0000-0003-3255-6743
  • Elkin Navarro Unidad de Genética y Biología Molecular, Facultad de Ciencias Básicas y Biomédicas, Universidad Simón Bolívar, Barranquilla, Colombia; Centro de Investigaciones en Ciencias de la Vida, Universidad Simón Bolívar, Barranquilla, Colombia https://orcid.org/0000-0001-7567-6409
  • Leonardo C. Pacheco Unidad de Genética y Biología Molecular, Facultad de Ciencias Básicas y Biomédicas, Universidad Simón Bolívar, Barranquilla, Colombia; Centro de Investigaciones en Ciencias de la Vida, Universidad Simón Bolívar, Barranquilla, Colombia https://orcid.org/0000-0002-5770-3706
  • Nataly Galán Unidad de Genética y Biología Molecular, Facultad de Ciencias Básicas y Biomédicas, Universidad Simón Bolívar, Barranquilla, Colombia; Centro de Investigaciones en Ciencias de la Vida, Universidad Simón Bolívar, Barranquilla, Colombia https://orcid.org/0000-0002-2096-7900
  • Ronald Maestre Centro de Investigaciones en Ciencias de la Vida, Universidad Simón Bolívar, Barranquilla, Colombia; Facultad de Ciencias de la Salud, Universidad Simón Bolívar, Barranquilla, Colombia https://orcid.org/0000-0002-5858-9829
  • Antonio Acosta Centro de Investigaciones en Ciencias de la Vida, Universidad Simón Bolívar, Barranquilla, Colombia; Facultad de Ciencias de la Salud, Universidad Simón Bolívar, Barranquilla, Colombia https://orcid.org/0000-0001-7443-3982
  • Lisandro A. Pacheco Centro de Investigaciones en Ciencias de la Vida, Universidad Simón Bolívar, Barranquilla, Colombia; Facultad de Ciencias de la Salud, Universidad Simón Bolívar, Barranquilla, Colombia https://orcid.org/0000-0002-9248-4596

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Cómo citar
1.
Hurtado L, Díaz D, Escorcia K, Flórez L, Bello Y, Díaz Y, et al. Validación clínica de la prueba RT-LAMP para el diagnóstico rápido del SARS-CoV-2. biomedica [Internet]. 31 de octubre de 2022 [citado 16 de abril de 2024];42(Sp. 2):59-72. Disponible en: https://revistabiomedica.org/index.php/biomedica/article/view/6523

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Publicado
2022-10-31
Número
Vol. 42 Núm. Sp. 2 (2022): Covid-19
Sección
Artículos originales

Derechos de autor 2022 Biomédica

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