Caracterización por electroforesis de campo pulsado de aislamientos de Salmonella Typhimurium recuperados en el programa de vigilancia de enfermedad diarreica aguda en Colombia, 1997-2004

Nélida Muñoz, María Elena Realpe, Elizabeth Castañeda, Clara Inés Agudelo, .

Palabras clave: Salmonella Typhimurium, vigilancia epidemiológica, diarrea, electroforesis en gel de campo pulsado, Colombia

Resumen


Introducción. En Colombia, Salmonella Typhimurium es el segundo serotipo más frecuentemente aislado en muestras clínicas humanas después de S. Enteritidis, y representa el 28,2% (n = 468) de los 1.659 aislamientos recuperados en el programa de vigilancia por el laboratorio de enfermedad diarreica aguda liderado por el Grupo de Microbiología del Instituto Nacional de Salud.
Objetivo. Caracterizar molecularmente los aislamientos de S. Typhimurium que circulan en el país con el fin de establecer su perfil y determinar su relación genética.
Materiales y métodos. En 468 aislamientos remitidos por 14 laboratorios de salud pública departamentales, recuperados entre enero de 1997 y diciembre de 2004, se determinó el perfil genómico por electroforesis de campo pulsado con la enzima de restricción XbaI según el protocolo de la Red PulseNet (CDC, Atlanta); el análisis de los geles se realizó con el programa Fingerprinting II.
Resultados. Se obtuvieron 180 patrones electroforéticos. Los patrones prevalentes fueron COINJPX.X01.0062, encontrado en 101 aislamientos (21,3%), seguido por los patrones COINJPX.X01.0001 en 40 (8,4%), COINJPX.X01.0058 en 13 (3%), COINJPX.X01.0003 en 12 (2,5%), COINJPX.X01.0066 en 11 (2,3%) y COINJPX.X01.0108 en 6 (1,4%). COINJPX.X01.0001, fue el patrón predominante en Bogotá hasta 2002, reemplazado a nivel nacional por el COINJPX.X01.0062. El análisis de agrupamiento mostró tres grupos con similitudes genéticas entre 53% y 82%, lo que revela la heterogeneidad genética del serotipo.
Conclusiones. El estudio permitió identificar patrones electroforéticos prevalentes, tener una base de datos nacional disponible para la comparación de los perfiles en tiempo real, detectar brotes y relacionar casos aparentemente aislados.

Descargas

La descarga de datos todavía no está disponible.
  • Nélida Muñoz Grupo de Microbiología, Instituto Nacional de Salud, Bogotá, D.C. Colombia.
  • María Elena Realpe Grupo de Microbiología, Instituto Nacional de Salud, Bogotá, D.C. Colombia.
  • Elizabeth Castañeda Grupo de Microbiología, Instituto Nacional de Salud, Bogotá, D.C. Colombia.
  • Clara Inés Agudelo Grupo de Microbiología, Instituto Nacional de Salud, Bogotá, D.C. Colombia.

Referencias

1. Valenzuela C. Control de enfermedades diarreicas. [Consultado: 3 de marzo de 2006] www.paho.org/spanish/AD/DPC/CD/AIEPI4-5.pdf.
2. Jaramillo E, Estrada S, Ospina S. Etiología de la enfermedad diarreica aguda (EDA) de origen bacteriano, utilizando un protocolo estandarizado de laboratorio. Infectio 1999;3:95-9.
3. Popoff MY. Antigenic formulas of the Salmonella serovars. 8th revision. Paris: Pasteur Institute, World Health Organization Collaborating Centre for Reference and Research on Salmonella; 2001.
4. Wang L, Andrianopoulos K, Liu D, Popoff MY, Reeves PR. Extensive variation in the O-antigen gene cluster within one Salmonella enterica serogroup reveals an unexpected complex history. J Bacteriol
2002;184:1669-77.
5. Olsen SJ, Bishop R, Brenner FW, Roels TH, Bean N, Tauxe RV, et al. The changing epidemiology of Salmonella: trends in serotypes isolated from humans in the United States, 1987-1997. J Infect Dis
2001;183:753-61.
6. CDC Salmonella surveillance. Annual summary, 2002. Atlanta, GE: US Deparment of Health and Human Services, CDC; 2003.
7. Organización Panamericana de la Salud. Reunión anual regional de los países participantes en la red de monitoreo de vigilancia de la resistencia a los antibióticos. Asunción, Paraguay, 31 Enero - 2 Febrero, 2001. [Consultado: 3 de marzo de 2006] OPS HCP/HCT/201/02. http://www.paho.org/Spanish/AD/DPC/CD/amr-resultados-2000.htm
8. Grupo de Microbiología, Instituto Nacional de Salud. Distribución de los aislamientos de Salmonella spp. por procedencia y por año 1997-2003. En Vigilancia de serotipos y patrones de susceptibilidad antimicrobiana de los patógenos de importancia en salud pública. Agudelo CI. [Consultado: 3 de marzo de 2006] Disponible: http://www.ins.gov.co/pdf_investiga/Microbiologia_salm_05.pdf
9. Guzmán-Blanco M, Casellas JM, Sader HS. Bacterial resistance to antimicrobial agents in Latin America. The giant is awakening. Infecf Dis Clin North Am 2000;14:67-81.
10. Bender JB, Hedberg CW, Boxrud DJ, Besser JM, Wicklund JH, Smith KE, et al. Use of molecular subtyping in surveillance for Salmonella enterica serotype Typhimurium. N Engl J Med 2001;344:189-
95.
11. Lindstedt BA, Heir E, Gjernes E, Kapperud G. DNA fingerprinting of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium with emphasis on phage type DT104 based on variable number of tandem repeat loci. J Clin Microbiol 2003;41:1469-79.
12. Lailler R, Grimont F, Jones Y, Sanders P, Brisabois A. Subtyping of Salmonella Typhimurium by pulsedfield gel electrophoresis and comparisons with phage types and resistance types. Pathol Biol 2002;50:361-8.
13. Tamada Y, Nakaoka Y, Nishimori K, Doi A, Kumaki T, Uemura N, et al. Molecular typing and epidemiological study of Salmonella enterica serotype Typhimurium isolates from cattle by fluorescent amplified-fragment length polymorphism fingerprinting and pulsed-field gel electrophoresis. J Clin Microbiol 2001;39:1057-66.
14. Swaminathan B, Barret TJ, Hunter SB, Tauxe RV, CDC PulseNet Task Force. PulseNet: the molecular subtyping network for foodborne bacterial disease surveillance, United States. Emerg Infect Dis
2001;7:382-9.
15. Soto S, Guerra B, Gonzáles M, Mendoza M. Potencial of three way randomly amplified polimorphic DNA analysis as a typing method for twelve Salmonella serotypes. Appl Environ Microbiol 1999;65:4830-6.
16. CDC, APHL. PulseNet. Atlanta, GA: U.S. Department of Health and Human Services, CDC; 2004. [Consultado 3 de marzo de 2006]. Disponible en: www.cdc.gov/pulsenet.
17. Red PulseNet América Latina. Pulsenet America Latina - Plan de Acción - 2004-2005. [Consultado: 3 de abril de 2006]. Disponible en: http://www.panalimentos.org/pulsenet/files/7773553729_PULSENET-Plan%20de%20Accion-22-05-04.doc.
18. Hidalgo M, Gracia M, Ovalle M, Wiesner M, Chávez J, Realpe ME, et al. Caracterización de los aislamientos de Salmonella Typhimurium, asociados con un brote de intoxicación alimentaria en una localidad de Pasto, Nariño. Inf Quinc Epidemiol Nac 2004;9:89-92.
19. Bopp CA, Brenner FW, Fields PI, Wells JG, Srockbine NA. Escherichia, Shigella and Salmonella. In: Murray PR, Baron EJ, Pfaller MA, Tenover FC, Yolken RH, editors. Manual of clinical microbiology. 8th ed. Washington, DC: American Society for Microbiology Press; 2003.p.654-83.
20. Hunter SB, Vauterin P, Lambert-Fair MA, Van Duyne S, Kubota K, Graves L, et al. Establishment of a universal size standard strain for use with the pulseNet standardize pulse-field gel electrophoresis protocols: converting the national data bases to the new size standard. J Clin Microbiol 2005;43:1045-50.
21. Wiesner M, Hidalgo M, Castañeda E, Agudelo CI. Molecular analysis of Salmonella Enteritidis and Typhimurium clinical and food isolates by Pulse-Field Gel Electrophoresis in Bogotá, Colombia. Microb Drug Resistant 2006;12:68-74.
22. Zhao S, Fedorka-Cray PJ, Friedman S, McDermott PF, Walter RD, Qaiyumi S, et al. Characterization of Salmonella Typhimurium origin obtained from the National Antimicrobial Resistance Monitoring System. Foodborne Pathog Dis 2005;2:169-81.
23. Guerra B, Schrors P, Mendoza MC. Application of PFGE performed with XbaI to an epidemiological and phylogenetic study of Salmonella serotype Typhimurium. Relations between genetic types and phage types. New Microbiol 2000;23:11-20.
24. Tsen HY, Lin JS, Hsih HY. Pulse field electrophoresis for animal Salmonella enterica serovar Typhimurium isolates in Taiwan. Vet Microbiol 2002;87:73-80.
25. On SL, Baggesen DL. Determination of clonal relationships of Salmonella Typhimurium by numerical analysis of macrorestriction profiles. J Appl Microbiol 1997;83:699-706.
26. Fakhr MK, Nolan LK, Logue CM. Multilocus sequence typing lacks the discriminatory ability of pulsed-field gel electrophoresis for typing Salmonella enterica serovar Typhimurium. J Clin Microbiol 2005;43:2215-9.
27. Oshibe T, Hamada K. Phylogenetic analysis of genotypic variations of Salmonella Enteritidis isolates from sporadic infections using pulsed field gel electrophoresis from December 1996 to November 2000 in Hyogo Prefecture. Jpn J Infect Dis 2001;54:40-3.
28. Sulakvelidze A, Kekelidze M, Turabelidze D, Tsanava S, Tevsadze L, Devdariani L, et al. Salmonellosis in the republic of Georgia: using molecular typing to identify the outbreak-causing strain. Emerg Infect Dis 2000;6:70-3.
29. Refsum T, Heir E, Kapperud G, Vardund T, Holstad T. Molecular epidemiology of Salmonella enterica serovar Typhimurium isolates determined by pulsedfield gel electrophoresis: comparison of isolates from avian wildlife, domestic animals and the environment in Norway. Appl Environ Microbiol 2002;68:5600-6.
Cómo citar
Muñoz, N., Realpe, M. E., Castañeda, E., & Agudelo, C. I. (1). Caracterización por electroforesis de campo pulsado de aislamientos de Salmonella Typhimurium recuperados en el programa de vigilancia de enfermedad diarreica aguda en Colombia, 1997-2004. Biomédica, 26(3), 397-407. https://doi.org/10.7705/biomedica.v26i3.358
Sección
Artículos originales