Aislamiento y caracterización de una cepa temprana de SARS-CoV-2 durante la epidemia de 2020 en Medellín, Colombia

Francisco J. Díaz; Wbeimar Aguilar-Jiménez; Lizdany Flórez-Álvarez; Gladys Valencia; Katherine  Laiton-Donato; Carlos  Franco-Muñoz; Diego  Álvarez-Díaz; Marcela  Mercado-Reyes; María Teresa Rugeles

doi:10.7705/biomedica.5834

Francisco J. Díaz, Wbeimar Aguilar-Jiménez, Lizdany Flórez-Álvarez, Gladys Valencia, Katherine Laiton-Donato, Carlos Franco-Muñoz, Diego Álvarez-Díaz, Marcela Mercado-Reyes, María Teresa Rugeles, .

DOI: https://doi.org/10.7705/biomedica.5834

Palabras clave: infecciones por coronavirus, síndrome respiratorio agudo grave, virus del SARS, secuenciación de nucleótidos de alto rendimiento, microscopia electrónica, técnica indirecta del anticuerpo fluorescente

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Resumen

Introducción. El nuevo coronavirus causante de un brote de enfermedad respiratoria aguda en China en diciembre de 2019 se identificó como SARS-CoV-2. La enfermedad, denominada COVID-19, fue declarada pandemia por la Organización Mundial de la Salud (OMS). El primer caso de COVID-19 en Colombia se reportó el 6 de marzo de 2020; en este estudio se caracterizó un aislamiento temprano del virus SARS-CoV-2 de una muestra ecolectada en abril de 2020.
Objetivos. Describir y caracterizar una cepa temprana a partir de un aislamiento de SARSCoV-2 durante la pandemia en Colombia.
Materiales y métodos. Se obtuvo una muestra de un paciente con COVID-19 confirmada por qRT-PCR; la muestra fue inoculada en diferentes líneas celulares hasta la aparición del efecto citopático. Para confirmar la presencia de SARS-CoV-2 en el cultivo, se utilizó la qRT-PCR a partir de los sobrenadantes, la inmunofluorescencia indirecta (IFI) en células Vero-E6, así como microscopía electrónica y secuenciación de nueva generación (nextgeneration sequencing).
Resultados. Se confirmó el aislamiento de SARS-CoV-2 en células Vero-E6 por la aparición del efecto citopático tres días después de la infección, así como mediante la qRT-PCR y la IFI positiva con suero de paciente convaleciente positivo para SARS-CoV-2. Además, en las imágenes de microscopía electrónica de trasmisión y de barrido de células infectadas se observaron estructuras compatibles con viriones de SARS-CoV-2. Por último, se obtuvo la secuencia completa del genoma, lo que permitió clasificar el aislamiento como linaje B.1.5.
Conclusiones. La evidencia presentada en este artículo permite confirmar el primer aislamiento de SARS-CoV-2 en Colombia. Además, muestra que esta cepa se comporta en cultivo celular de manera similar a lo reportado en la literatura para otros aislamientos y que su composición genética está acorde con la variante predominante en el mundo. Finalmente, se resalta la importancia que tiene el aislamiento viral para la detección de anticuerpos, para la caracterización genotípica y fenotípica de la cepa y para probar compuestos con potencial antiviral.

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Francisco J. Díaz Grupo de Inmunovirología, Facultad de Medicina, Universidad de Antioquia, Medellín, Colombia https://orcid.org/0000-0003-3352-3652
Wbeimar Aguilar-Jiménez Grupo de Inmunovirología, Facultad de Medicina, Universidad de Antioquia, Medellín, Colombia https://orcid.org/0000-0002-0790-055X
Lizdany Flórez-Álvarez Grupo de Inmunovirología, Facultad de Medicina, Universidad de Antioquia, Medellín, Colombia https://orcid.org/0000-0001-5443-8647
Gladys Valencia Ayudas Diagnósticas de Laboratorio Clínico, ADILAB, Medellín, Colombia
Katherine Laiton-Donato Unidad de Secuenciación Genómica, Instituto Nacional de Salud, Bogotá, D.C., Colombia https://orcid.org/0000-0003-1383-3127
Carlos Franco-Muñoz Unidad de Secuenciación Genómica, Instituto Nacional de Salud, Bogotá, D.C., Colombia https://orcid.org/0000-0003-3140-8167
Diego Álvarez-Díaz Unidad de Secuenciación Genómica, Instituto Nacional de Salud, Bogotá, D.C., Colombia https://orcid.org/0000-0002-6534-0079
Marcela Mercado-Reyes Unidad de Secuenciación Genómica, Instituto Nacional de Salud, Bogotá, D.C., Colombia https://orcid.org/0000-0003-3721-3176
María Teresa Rugeles Grupo de Inmunovirología, Facultad de Medicina, Universidad de Antioquia, Medellín, Colombia https://orcid.org/0000-0001-7855-1409

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Cómo citar

1.

Díaz FJ, Aguilar-Jiménez W, Flórez-Álvarez L, Valencia G, Laiton-Donato K, Franco-Muñoz C, Álvarez-Díaz D, Mercado-Reyes M, Rugeles MT. Aislamiento y caracterización de una cepa temprana de SARS-CoV-2 durante la epidemia de 2020 en Medellín, Colombia. biomedica [Internet]. 30 de octubre de 2020 [citado 24 de octubre de 2021];40(Supl. 2):148-5. Disponible en: https://revistabiomedica.org/index.php/biomedica/article/view/5834

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