Secuenciación del SARS-CoV-2: la iniciativa tecnológica para fortalecer los sistemas de alerta temprana ante emergencias de salud pública en Latinoamérica y el Caribe

Diego A. Álvarez-Díaz, Katherine Laiton-Donato, Carlos Franco-Muñoz, Marcela Mercado-Reyes, .

DOI: https://doi.org/10.7705/biomedica.5841
Palabras clave: infecciones por coronavirus, síndrome respiratorio agudo grave, virus del SRAS, secuenciación de nucleótidos de alto rendimiento, vigilancia epidemiológica, políticas en salud pública
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Resumen

La pandemia de COVID-19 causada por el SARS-CoV-2 es un problema de salud pública sin precedentes en los últimos 100 años, así como la respuesta centrada en la caracterización genómica del SARS-CoV-2 prácticamente en todas las regiones del planeta. Esta pandemia surgió durante la era de la epidemiología genómica impulsada por los continuos avances en la secuenciación de próxima generación. Desde su reciente aparición, la epidemiología genómica permitió la identificación precisa de nuevos linajes o especies de agentes patógenos y la reconstrucción de su variabilidad genética en tiempo real, lo que se hizo evidente en los brotes de influenza H1N1, MERS y SARS. Sin embargo, la escala global y descontrolada de esta pandemia ha generado una situación que obligó a utilizar de forma masiva herramientas de la epidemiología genómica como la rápida identificación del SARS-CoV-2 y el registro de nuevos linajes y su vigilancia activa en todo el mundo. Antes de la pandemia de COVID-19 la disponibilidad e datos genómicos de agentes patógenos circulantes en varios países de Latinoamérica y el Caribe era escasa o nula. Con la llegada del SARS-CoV-2 dicha situación cambió significativamente, aunque la cantidad de información disponible sigue siendo escasa y, en países como Colombia, Brasil, Argentina y Chile, la información genómica del SARS-CoV-2 provino principalmente de grupos de investigación en epidemiología genómica más que como producto de una política o programa de vigilancia en salud pública.

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  • Diego A. Álvarez-Díaz Unidad de Secuenciación y Genómica, Dirección de Investigación en Salud Pública, Instituto Nacional de Salud, Bogotá, D.C., Colombia; Grupo de Salud Materna y Perinatal, Dirección de Investigación en Salud Pública, Instituto Nacional de Salud, Bogotá, D.C., Colombia https://orcid.org/0000-0002-6534-0079
  • Katherine Laiton-Donato Unidad de Secuenciación y Genómica, Dirección de Investigación en Salud Pública, Instituto Nacional de Salud, Bogotá, D.C., Colombia http://orcid.org/0000-0003-1383-3127
  • Carlos Franco-Muñoz Grupo de Parasitología, Dirección de Investigación en Salud Pública, Instituto Nacional de Salud, Bogotá, D. C.,Colombia https://orcid.org/0000-0003-3140-8167
  • Marcela Mercado-Reyes Grupo de Salud Materna y Perinatal, Dirección de Investigación en Salud Pública, Instituto Nacional de Salud, Bogotá, Colombia; Dirección de Investigación en Salud Pública, Instituto Nacional de Salud, Bogotá, D.C., Colombia https://orcid.org/0000-0003-3721-3176

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Cómo citar
1.
Álvarez-Díaz DA, Laiton-Donato K, Franco-Muñoz C, Mercado-Reyes M. Secuenciación del SARS-CoV-2: la iniciativa tecnológica para fortalecer los sistemas de alerta temprana ante emergencias de salud pública en Latinoamérica y el Caribe. biomedica [Internet]. 30 de octubre de 2020 [citado 20 de abril de 2024];40(Supl. 2):188-97. Disponible en: https://revistabiomedica.org/index.php/biomedica/article/view/5841

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Publicado
2020-10-30
Número
Vol. 40 Núm. Supl. 2 (2020): SARS-CoV-2 y COVID-19
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